Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT1P21579 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT1P21579 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT1P21579 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT1P21579 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT1P21579 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT1P21579 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT1P21579 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT1P21579 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms