Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACO1P21399 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACO1P21399 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACO1P21399 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms