Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD247P20963 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD247P20963 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD247P20963 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD247P20963 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CD247P20963 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CD247P20963 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CD247P20963 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms