Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA5P20719 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms