Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms