Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD58P19256 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD58P19256 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD58P19256 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD58P19256 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD58P19256 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD58P19256 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD58P19256 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms