Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB6P18564 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms