Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYN1P17600 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYN1P17600 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYN1P17600 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYN1P17600 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYN1P17600 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYN1P17600 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms