Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EPCAMP16422 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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