Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA4P13612 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms