Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL5P13501 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL5P13501 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL5P13501 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL5P13501 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL5P13501 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL5P13501 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL5P13501 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL5P13501 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms