Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HKR1P10072 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HKR1P10072 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms