Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2BP0DI82 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC2BP0DI82 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms