Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACAA1P09110 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms