Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP3A4P08684 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP3A4P08684 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP3A4P08684 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYP3A4P08684 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP3A4P08684 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP3A4P08684 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms