Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFMP07197 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFMP07197 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFMP07197 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFMP07197 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFMP07197 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFMP07197 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFMP07197 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFMP07197 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFMP07197 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFMP07197 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFMP07197 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFMP07197 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFMP07197 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFMP07197 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFMP07197 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFMP07197 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFMP07197 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFMP07197 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFMP07197 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFMP07197 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFMP07197 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms