Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VTNP04004 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VTNP04004 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VTNP04004 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VTNP04004 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VTNP04004 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VTNP04004 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VTNP04004 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VTNP04004 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms