Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGAP02671 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGAP02671 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGAP02671 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGAP02671 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGAP02671 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGAP02671 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGAP02671 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGAP02671 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGAP02671 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGAP02671 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGAP02671 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms