Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOA1P02647 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms