Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-AP01891 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms