Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHG1P01857 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHG1P01857 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHG1P01857 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHG1P01857 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHG1P01857 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHG1P01857 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHG1P01857 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHG1P01857 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms