Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EGFRP00533 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EGFRP00533 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EGFRP00533 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EGFRP00533 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EGFRP00533 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EGFRP00533 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms