Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5LO95447 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms