Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BBOX1O75936 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBOX1O75936 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBOX1O75936 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms