Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SURF6O75683 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SURF6O75683 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SURF6O75683 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF6O75683 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF6O75683 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SURF6O75683 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SURF6O75683 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SURF6O75683 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SURF6O75683 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SURF6O75683 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SURF6O75683 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SURF6O75683 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SURF6O75683 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SURF6O75683 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SURF6O75683 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms