Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA4O75335 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPFIA4O75335 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms