Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUTAO60888 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUTAO60888 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CUTAO60888 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CUTAO60888 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUTAO60888 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUTAO60888 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms