Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH6O60337 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms