Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CREB3O43889 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CREB3O43889 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREB3O43889 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREB3O43889 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREB3O43889 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms