Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP9BO43861 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP9BO43861 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms