Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYNGR2O43760 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms