Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DENRO43583 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DENRO43583 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DENRO43583 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DENRO43583 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms