Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIAH2O43255 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIAH2O43255 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms