Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSH5O43196 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSH5O43196 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MSH5O43196 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MSH5O43196 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MSH5O43196 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MSH5O43196 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MSH5O43196 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MSH5O43196 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms