Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIPA1L1O43166 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1L1O43166 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms