Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARPC5O15511 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms