Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARPC1BO15143 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARPC1BO15143 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms