Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SETD1AO15047 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms