Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APAF1O14727 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APAF1O14727 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APAF1O14727 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APAF1O14727 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APAF1O14727 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APAF1O14727 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APAF1O14727 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APAF1O14727 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APAF1O14727 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APAF1O14727 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APAF1O14727 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APAF1O14727 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APAF1O14727 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms