Protein–RNA interactions for Protein: O00570

SOX1, Transcription factor SOX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX1O00570 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX1O00570 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX1O00570 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX1O00570 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX1O00570 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX1O00570 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX1O00570 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX1O00570 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX1O00570 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms