Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLRMTO00411 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms