Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms