Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E9PBE3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E9PBE3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E9PBE3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E9PBE3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E9PBE3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms