Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BL2E5RIL1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UPK3BL2E5RIL1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms