Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL2C9JE40 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms