Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L5A8MUK1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L5A8MUK1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms