Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOTOA8MTQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOTOA8MTQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms