Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms