Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MAP1LC3B2A6NCE7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms