Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37CA5D8V6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS37CA5D8V6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms